Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCFC2P16383 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCFC2P16383 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms