Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HKR1P10072 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HKR1P10072 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HKR1P10072 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HKR1P10072 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HKR1P10072 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms