Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP3P08254 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP3P08254 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP3P08254 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP3P08254 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP3P08254 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP3P08254 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms