Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSF1RP07333 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSF1RP07333 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms