Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT18P05783 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT18P05783 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT18P05783 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT18P05783 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT18P05783 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms