Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APODP05090 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APODP05090 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APODP05090 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APODP05090 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APODP05090 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
APODP05090 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APODP05090 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APODP05090 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APODP05090 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms