Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms