Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA3O96018 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APBA3O96018 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APBA3O96018 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APBA3O96018 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APBA3O96018 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APBA3O96018 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APBA3O96018 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms