Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP4K4O95819 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP4K4O95819 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms