Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCB11O95342 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCB11O95342 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms