Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP19O94966 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP19O94966 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP19O94966 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP19O94966 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP19O94966 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP19O94966 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP19O94966 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP19O94966 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms