Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSDE1O75534 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSDE1O75534 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms