Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VAMP4O75379 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms