Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD2O60548 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD2O60548 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD2O60548 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD2O60548 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms