Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMARCA5O60264 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMARCA5O60264 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms