Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3AO14802 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3AO14802 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms