Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SOCS3O14543 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS3O14543 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms