Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CDO00329 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms