Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP23O00161 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP23O00161 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms