Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
I3L3M4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
I3L3M4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
I3L3M4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
I3L3M4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
I3L3M4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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