Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NJR5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NJR5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NJR5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NJR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NJR5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NJR5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NJR5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NJR5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJR5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJR5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms