Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POTEFA5A3E0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POTEFA5A3E0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms