Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms