Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl40Q9Z2Q5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl40Q9Z2Q5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms