Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PapolbQ9WVP6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PapolbQ9WVP6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PapolbQ9WVP6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PapolbQ9WVP6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PapolbQ9WVP6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PapolbQ9WVP6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PapolbQ9WVP6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms