Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plod3Q9R0E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plod3Q9R0E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Plod3Q9R0E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plod3Q9R0E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Plod3Q9R0E1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plod3Q9R0E1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Plod3Q9R0E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Plod3Q9R0E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Plod3Q9R0E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Plod3Q9R0E1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Plod3Q9R0E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Plod3Q9R0E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Plod3Q9R0E1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Plod3Q9R0E1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms