Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff2Q9QYM9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff2Q9QYM9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmeff2Q9QYM9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmeff2Q9QYM9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmeff2Q9QYM9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmeff2Q9QYM9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmeff2Q9QYM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmeff2Q9QYM9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff2Q9QYM9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff2Q9QYM9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff2Q9QYM9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms