Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ropn1Q9ESG2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ropn1Q9ESG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ropn1Q9ESG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ropn1Q9ESG2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ropn1Q9ESG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ropn1Q9ESG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms