Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OtofQ9ESF1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OtofQ9ESF1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OtofQ9ESF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OtofQ9ESF1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OtofQ9ESF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OtofQ9ESF1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OtofQ9ESF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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