Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Zbed3Q9D0L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zbed3Q9D0L1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zbed3Q9D0L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zbed3Q9D0L1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zbed3Q9D0L1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Zbed3Q9D0L1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
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