Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmss1Q9CZT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmss1Q9CZT6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cmss1Q9CZT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cmss1Q9CZT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmss1Q9CZT6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmss1Q9CZT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms