Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
1700129C05RikQ9CQ77 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700129C05RikQ9CQ77 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700129C05RikQ9CQ77 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
1700129C05RikQ9CQ77 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
1700129C05RikQ9CQ77 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700129C05RikQ9CQ77 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700129C05RikQ9CQ77 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700129C05RikQ9CQ77 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms