Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ3

Uncharacterized protein C1orf185 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CPZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CPZ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CPZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9CPZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9CPZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CPZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms