Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lactb2Q99KR3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lactb2Q99KR3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lactb2Q99KR3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lactb2Q99KR3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lactb2Q99KR3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lactb2Q99KR3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms