Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacsin3Q99JB8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pacsin3Q99JB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pacsin3Q99JB8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pacsin3Q99JB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pacsin3Q99JB8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacsin3Q99JB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms