Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NifkQ91VE6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NifkQ91VE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NifkQ91VE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NifkQ91VE6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NifkQ91VE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NifkQ91VE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms