Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cnot6lQ8VEG6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnot6lQ8VEG6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnot6lQ8VEG6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnot6lQ8VEG6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnot6lQ8VEG6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnot6lQ8VEG6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnot6lQ8VEG6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnot6lQ8VEG6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnot6lQ8VEG6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnot6lQ8VEG6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnot6lQ8VEG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cnot6lQ8VEG6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnot6lQ8VEG6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnot6lQ8VEG6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnot6lQ8VEG6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnot6lQ8VEG6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms