Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2S1

Rps6kl1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kl1Q8R2S1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps6kl1Q8R2S1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rps6kl1Q8R2S1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6kl1Q8R2S1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6kl1Q8R2S1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps6kl1Q8R2S1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps6kl1Q8R2S1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps6kl1Q8R2S1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms