Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVG5

SAMD9L, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9LQ8IVG5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SAMD9LQ8IVG5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SAMD9LQ8IVG5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SAMD9LQ8IVG5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SAMD9LQ8IVG5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SAMD9LQ8IVG5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SAMD9LQ8IVG5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SAMD9LQ8IVG5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SAMD9LQ8IVG5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SAMD9LQ8IVG5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SAMD9LQ8IVG5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SAMD9LQ8IVG5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9LQ8IVG5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms