Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lsm14bQ8CGC4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lsm14bQ8CGC4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsm14bQ8CGC4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lsm14bQ8CGC4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lsm14bQ8CGC4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsm14bQ8CGC4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsm14bQ8CGC4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lsm14bQ8CGC4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lsm14bQ8CGC4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lsm14bQ8CGC4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms