Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ppfibp1Q8C8U0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,08■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Ppfibp1Q8C8U0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ppfibp1Q8C8U0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Ppfibp1Q8C8U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ppfibp1Q8C8U0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms