Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rps6ka5Q8C050 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rps6ka5Q8C050 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka5Q8C050 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rps6ka5Q8C050 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rps6ka5Q8C050 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps6ka5Q8C050 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps6ka5Q8C050 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka5Q8C050 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rps6ka5Q8C050 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rps6ka5Q8C050 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rps6ka5Q8C050 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms