Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot10Q8BH15 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot10Q8BH15 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cnot10Q8BH15 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot10Q8BH15 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot10Q8BH15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms