Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt12Q8BG71 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt12Q8BG71 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt12Q8BG71 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt12Q8BG71 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt12Q8BG71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trmt12Q8BG71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trmt12Q8BG71 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt12Q8BG71 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trmt12Q8BG71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt12Q8BG71 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt12Q8BG71 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms