Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smap2Q7TN29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smap2Q7TN29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smap2Q7TN29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smap2Q7TN29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smap2Q7TN29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms