Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SyncripQ7TMK9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SyncripQ7TMK9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SyncripQ7TMK9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SyncripQ7TMK9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SyncripQ7TMK9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SyncripQ7TMK9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SyncripQ7TMK9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms