Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms