Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp17leQ7M764 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17leQ7M764 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17leQ7M764 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17leQ7M764 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp17leQ7M764 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp17leQ7M764 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17leQ7M764 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp17leQ7M764 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms