Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 37
SND1Q7KZF4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 37
SND1Q7KZF4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 37
SND1Q7KZF4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 37
SND1Q7KZF4 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 37
SND1Q7KZF4 CALR-203ENST00000586803 667 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-36■■■■■ 37
SND1Q7KZF4 DPP4-209ENST00000494507 582 ntTSL 210.71□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 RHAG-201ENST00000229810 1283 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.624e-28■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-28■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 RHAG-203ENST00000618248 1203 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.814e-28■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 TMEM147-206ENST00000595180 546 ntTSL 219.64■□□□□ 0.734e-10■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 FAF2-202ENST00000504983 613 ntTSL 56.85□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 36.9
SND1Q7KZF4 HPX-211ENST00000534429 486 ntTSL 312.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 36.8
SND1Q7KZF4 SLC3A2-217ENST00000541425 595 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-14■■■■■ 36.7
SND1Q7KZF4 CTSD-206ENST00000497544 783 ntTSL 220.85■□□□□ 0.934e-38■■■■■ 36.7
SND1Q7KZF4 DHCR7-210ENST00000533800 837 ntTSL 316.04■□□□□ 0.162e-18■■■■■ 36.7
SND1Q7KZF4 DHCR7-203ENST00000525137 996 ntTSL 315.73■□□□□ 0.112e-18■■■■■ 36.7
SND1Q7KZF4 DHCR7-212ENST00000534795 979 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-18■■■■■ 36.7
SND1Q7KZF4 FGB-201ENST00000302068 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.811e-22■■■■■ 36.6
SND1Q7KZF4 FGB-206ENST00000502545 1320 ntTSL 59.93□□□□□ -0.821e-22■■■■■ 36.6
SND1Q7KZF4 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.141e-22■■■■■ 36.6
SND1Q7KZF4 HPX-209ENST00000533561 429 ntTSL 511.91□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 36.6
SND1Q7KZF4 SLC3A2-207ENST00000535768 597 ntTSL 510.12□□□□□ -0.797e-18■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 212.26□□□□□ -0.454e-21■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-10■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-10■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 S100A6-203ENST00000462776 479 ntTSL 214.69□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.257e-10■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.042e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.052e-11■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 GHDC-209ENST00000588762 842 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 CFI-206ENST00000515512 791 ntTSL 26.33□□□□□ -1.48e-19■■■■■ 36.5
SND1Q7KZF4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.433e-22■■■■■ 36.4
SND1Q7KZF4 NAGLU-205ENST00000592454 582 ntTSL 216.43■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 36.4
SND1Q7KZF4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 36.4
SND1Q7KZF4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 36.4
SND1Q7KZF4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 36.4
SND1Q7KZF4 GANAB-207ENST00000526732 824 ntTSL 213.05□□□□□ -0.327e-27■■■■■ 36.3
SND1Q7KZF4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.134e-9■■■■■ 36.3
SND1Q7KZF4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.54e-9■■■■■ 36.3
SND1Q7KZF4 PRCP-212ENST00000532476 571 ntTSL 45.76□□□□□ -1.491e-9■■■■■ 36.2
SND1Q7KZF4 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)25.15■■□□□ 1.628e-10■■■■■ 36.1
SND1Q7KZF4 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 222.83■■□□□ 1.258e-10■■■■■ 36.1
SND1Q7KZF4 ITM2B-204ENST00000607866 596 ntTSL 37.99□□□□□ -1.131e-10■■■■■ 36.1
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SND1Q7KZF4 AL049779.1-204ENST00000557564 274 ntAPPRIS P1 TSL 2-2.4□□□□□ -2.798e-8■■■■■ 36.1
SND1Q7KZF4 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-45■■■■■ 36
SND1Q7KZF4 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-45■■■■■ 36
SND1Q7KZF4 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 36
SND1Q7KZF4 HPX-208ENST00000533369 536 ntTSL 212.82□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 P4HA2-216ENST00000467587 456 ntTSL 26.94□□□□□ -1.31e-9■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-213ENST00000470873 552 ntTSL 418.66■□□□□ 0.583e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-209ENST00000412438 588 ntTSL 317.77■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-217ENST00000493804 807 ntTSL 216.19■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 35.9
SND1Q7KZF4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.668e-14■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.384e-15■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.334e-15■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-15■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.294e-15■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-15■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.164e-15■■■■■ 35.8
SND1Q7KZF4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-210ENST00000481084 2343 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-219ENST00000640747 1813 ntTSL 516.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-204ENST00000414373 1638 ntTSL 514.84□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-202ENST00000392834 1817 ntTSL 214.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-212ENST00000525456 1020 ntTSL 514.16□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 512.81□□□□□ -0.364e-8■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 DPAGT1-205ENST00000442480 999 ntTSL 58.79□□□□□ -11e-7■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 HYOU1-205ENST00000529174 549 ntTSL 418.6■□□□□ 0.572e-14■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-37■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-37■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-37■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.842e-37■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.172e-37■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-37■■■■■ 35.7
SND1Q7KZF4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.418e-12■■■■■ 35.6
SND1Q7KZF4 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 312.18□□□□□ -0.468e-12■■■■■ 35.6
SND1Q7KZF4 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 212.09□□□□□ -0.478e-12■■■■■ 35.6
SND1Q7KZF4 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.588e-12■■■■■ 35.6
SND1Q7KZF4 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.848e-12■■■■■ 35.6
SND1Q7KZF4 GLB1-209ENST00000450835 540 ntTSL 414.14□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 35.6
SND1Q7KZF4 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 26.15□□□□□ -1.429e-12■■■■■ 35.5
SND1Q7KZF4 DPP4-208ENST00000491591 969 ntTSL 312.83□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 35.5
SND1Q7KZF4 CPVL-211ENST00000458405 525 ntTSL 411.3□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 35.5
SND1Q7KZF4 MYADM-207ENST00000421337 1009 ntTSL 218.88■□□□□ 0.616e-15■■■■■ 35.4
SND1Q7KZF4 MYADM-208ENST00000439000 841 ntTSL 314.18□□□□□ -0.146e-15■■■■■ 35.4
SND1Q7KZF4 ESYT1-204ENST00000548142 563 ntTSL 312.2□□□□□ -0.464e-10■■■■■ 35.3
Retrieved 100 of 13,567 protein–RNA pairs in 395.3 ms