Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc4Q6S5L9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shc4Q6S5L9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shc4Q6S5L9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shc4Q6S5L9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Shc4Q6S5L9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shc4Q6S5L9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms