Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sarm1Q6PDS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sarm1Q6PDS3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sarm1Q6PDS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sarm1Q6PDS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sarm1Q6PDS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sarm1Q6PDS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sarm1Q6PDS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sarm1Q6PDS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms